Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71DQ8N9W8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms