Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00612Q8N6U2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms