Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms