Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC83Q8IWF9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms