Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms