Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms