Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms