Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms