Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms