Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms