Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms