Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOCADQ5VW36 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms