Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIPQ5VU43 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms