Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDK2Q58EX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms