Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms