Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms