Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PKDCCQ504Y2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKDCCQ504Y2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms