Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms