Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms