Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B9

YOR008C-A, Uncharacterized protein YOR008C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR008C-AQ3E7B9 YER006C-AYER006C-A 318 nt-2.71□□□□□ -2.84
YOR008C-AQ3E7B9 YNL028WYNL028W 318 nt-2.72□□□□□ -2.84
YOR008C-AQ3E7B9 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.72□□□□□ -2.84
YOR008C-AQ3E7B9 YEL014CYEL014C 306 nt-2.73□□□□□ -2.85
YOR008C-AQ3E7B9 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-2.73□□□□□ -2.85
YOR008C-AQ3E7B9 YPR197CYPR197C 564 nt-2.74□□□□□ -2.85
YOR008C-AQ3E7B9 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.75□□□□□ -2.85
YOR008C-AQ3E7B9 YPR012WYPR012W 255 nt-2.78□□□□□ -2.85
YOR008C-AQ3E7B9 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.79□□□□□ -2.86
YOR008C-AQ3E7B9 snR78snR78 87 nt-2.8□□□□□ -2.86
YOR008C-AQ3E7B9 snR41snR41 95 nt-2.8□□□□□ -2.86
YOR008C-AQ3E7B9 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.81□□□□□ -2.86
YOR008C-AQ3E7B9 snR6snR6 112 nt-2.85□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-2.85□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.86□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.87□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.88□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.9□□□□□ -2.87
YOR008C-AQ3E7B9 snR55snR55 98 nt-2.91□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 HTL1YCR020W-B 237 nt-2.92□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 YER181CYER181C 324 nt-2.93□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.95□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 snR73snR73 106 nt-2.97□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 STE18YJR086W 333 nt-2.97□□□□□ -2.88
YOR008C-AQ3E7B9 YNL122CYNL122C 348 nt-3□□□□□ -2.89
YOR008C-AQ3E7B9 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3□□□□□ -2.89
YOR008C-AQ3E7B9 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-3.01□□□□□ -2.89
YOR008C-AQ3E7B9 BIL1YOR304C-A 231 nt-3.03□□□□□ -2.89
YOR008C-AQ3E7B9 YDR413CYDR413C 576 nt-3.04□□□□□ -2.9
YOR008C-AQ3E7B9 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-3.04□□□□□ -2.9
YOR008C-AQ3E7B9 Q0142Q0142 177 nt-3.08□□□□□ -2.9
YOR008C-AQ3E7B9 snR80snR80 171 nt-3.09□□□□□ -2.9
YOR008C-AQ3E7B9 YKL123WYKL123W 381 nt-3.09□□□□□ -2.9
YOR008C-AQ3E7B9 YJL150WYJL150W 303 nt-3.1□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 Q0255Q0255 1419 nt-3.11□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.12□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 YOR102WYOR102W 351 nt-3.13□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.14□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.14□□□□□ -2.91
YOR008C-AQ3E7B9 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-3.18□□□□□ -2.92
YOR008C-AQ3E7B9 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-3.19□□□□□ -2.92
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-3.2□□□□□ -2.92
YOR008C-AQ3E7B9 snR48snR48 113 nt-3.22□□□□□ -2.92
YOR008C-AQ3E7B9 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.23□□□□□ -2.93
YOR008C-AQ3E7B9 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-3.23□□□□□ -2.93
YOR008C-AQ3E7B9 YKL118WYKL118W 312 nt-3.25□□□□□ -2.93
YOR008C-AQ3E7B9 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-3.27□□□□□ -2.93
YOR008C-AQ3E7B9 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-3.3□□□□□ -2.94
YOR008C-AQ3E7B9 YGR035CYGR035C 351 nt-3.32□□□□□ -2.94
YOR008C-AQ3E7B9 GIM4YEL003W 336 nt-3.33□□□□□ -2.94
YOR008C-AQ3E7B9 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-3.35□□□□□ -2.95
YOR008C-AQ3E7B9 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.36□□□□□ -2.95
YOR008C-AQ3E7B9 snR38snR38 95 nt-3.38□□□□□ -2.95
YOR008C-AQ3E7B9 RPL41AYDL184C 78 nt-3.4□□□□□ -2.95
YOR008C-AQ3E7B9 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-3.4□□□□□ -2.95
YOR008C-AQ3E7B9 YNL337WYNL337W 255 nt-3.47□□□□□ -2.96
YOR008C-AQ3E7B9 YJR162CYJR162C 351 nt-3.52□□□□□ -2.97
YOR008C-AQ3E7B9 YNR025CYNR025C 360 nt-3.54□□□□□ -2.98
YOR008C-AQ3E7B9 snR56snR56 88 nt-3.55□□□□□ -2.98
YOR008C-AQ3E7B9 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-3.57□□□□□ -2.98
YOR008C-AQ3E7B9 YNL198CYNL198C 303 nt-3.57□□□□□ -2.98
YOR008C-AQ3E7B9 snR87snR87 109 nt-3.59□□□□□ -2.98
YOR008C-AQ3E7B9 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.62□□□□□ -2.99
YOR008C-AQ3E7B9 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-3.63□□□□□ -2.99
YOR008C-AQ3E7B9 YOR302WYOR302W 78 nt-3.65□□□□□ -2.99
YOR008C-AQ3E7B9 snR52snR52 92 nt-3.65□□□□□ -2.99
YOR008C-AQ3E7B9 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.71□□□□□ -3
YOR008C-AQ3E7B9 RPL39YJL189W 156 nt-3.72□□□□□ -3
YOR008C-AQ3E7B9 snR85snR85 171 nt-3.73□□□□□ -3.01
YOR008C-AQ3E7B9 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.77□□□□□ -3.01
YOR008C-AQ3E7B9 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.78□□□□□ -3.01
YOR008C-AQ3E7B9 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.79□□□□□ -3.02
YOR008C-AQ3E7B9 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.85□□□□□ -3.03
YOR008C-AQ3E7B9 snR47snR47 99 nt-3.87□□□□□ -3.03
YOR008C-AQ3E7B9 YGR151CYGR151C 336 nt-3.94□□□□□ -3.04
YOR008C-AQ3E7B9 YBL053WYBL053W 375 nt-3.96□□□□□ -3.04
YOR008C-AQ3E7B9 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.98□□□□□ -3.05
YOR008C-AQ3E7B9 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-4.01□□□□□ -3.05
YOR008C-AQ3E7B9 SPG3YDR504C 384 nt-4.03□□□□□ -3.05
YOR008C-AQ3E7B9 YKL225WYKL225W 348 nt-4.08□□□□□ -3.06
YOR008C-AQ3E7B9 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-4.09□□□□□ -3.06
YOR008C-AQ3E7B9 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.1□□□□□ -3.07
YOR008C-AQ3E7B9 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-4.13□□□□□ -3.07
YOR008C-AQ3E7B9 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-4.15□□□□□ -3.07
YOR008C-AQ3E7B9 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-4.15□□□□□ -3.07
YOR008C-AQ3E7B9 YDR157WYDR157W 402 nt-4.16□□□□□ -3.08
YOR008C-AQ3E7B9 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-4.19□□□□□ -3.08
YOR008C-AQ3E7B9 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-4.2□□□□□ -3.08
YOR008C-AQ3E7B9 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.22□□□□□ -3.08
YOR008C-AQ3E7B9 snR58snR58 96 nt-4.23□□□□□ -3.09
YOR008C-AQ3E7B9 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.35□□□□□ -3.11
YOR008C-AQ3E7B9 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.36□□□□□ -3.11
YOR008C-AQ3E7B9 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-4.37□□□□□ -3.11
YOR008C-AQ3E7B9 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.37□□□□□ -3.11
YOR008C-AQ3E7B9 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.39□□□□□ -3.11
YOR008C-AQ3E7B9 snR65snR65 100 nt-4.42□□□□□ -3.12
YOR008C-AQ3E7B9 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-4.59□□□□□ -3.14
YOR008C-AQ3E7B9 YNL170WYNL170W 396 nt-4.65□□□□□ -3.15
YOR008C-AQ3E7B9 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-4.77□□□□□ -3.17
YOR008C-AQ3E7B9 Q0017Q0017 162 nt-4.77□□□□□ -3.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms