Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IMPG1Q17R60 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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