Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms