Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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