Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA2Q15822 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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