Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYTH1Q15438 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYTH1Q15438 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms