Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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