Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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