Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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