Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IHHQ14623 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IHHQ14623 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IHHQ14623 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IHHQ14623 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms