Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCINQ13939 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCINQ13939 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCINQ13939 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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