Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms