Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCGQ13326 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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