Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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