Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms