Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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