Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeastyeast

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA17Q12513 YNL338WYNL338W 159 nt0.45□□□□□ -2.34
TMA17Q12513 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.43□□□□□ -2.34
TMA17Q12513 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.42□□□□□ -2.34
TMA17Q12513 YBR099CYBR099C 384 nt0.42□□□□□ -2.34
TMA17Q12513 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.41□□□□□ -2.34
TMA17Q12513 YOR225WYOR225W 330 nt0.38□□□□□ -2.35
TMA17Q12513 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.36□□□□□ -2.35
TMA17Q12513 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 YNL205CYNL205C 423 nt0.33□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.31□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 YBL053WYBL053W 375 nt0.31□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 AI1Q0050 2505 nt0.28□□□□□ -2.36
TMA17Q12513 ESP1YGR098C 4893 nt0.27□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 EST1YLR233C 2100 nt0.26□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 YLR294CYLR294C 330 nt0.26□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 PMP2YEL017C-A 132 nt0.25□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.24□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 snR69snR69 101 nt0.22□□□□□ -2.37
TMA17Q12513 SOM1YEL059C-A 225 nt0.2□□□□□ -2.38
TMA17Q12513 SOV1YMR066W 2697 nt0.18□□□□□ -2.38
TMA17Q12513 YOL014WYOL014W 375 nt0.18□□□□□ -2.38
TMA17Q12513 SEC10YLR166C 2616 nt0.15□□□□□ -2.39
TMA17Q12513 YGR164WYGR164W 336 nt0.14□□□□□ -2.39
TMA17Q12513 RDS3YPR094W 324 nt0.14□□□□□ -2.39
TMA17Q12513 THO2YNL139C 4794 nt0.12□□□□□ -2.39
TMA17Q12513 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.11□□□□□ -2.39
TMA17Q12513 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.09□□□□□ -2.4
TMA17Q12513 YNL266WYNL266W 420 nt0.09□□□□□ -2.4
TMA17Q12513 snR128snR128 126 nt0.07□□□□□ -2.4
TMA17Q12513 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.05□□□□□ -2.4
TMA17Q12513 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.02□□□□□ -2.41
TMA17Q12513 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.01□□□□□ -2.41
TMA17Q12513 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.02□□□□□ -2.41
TMA17Q12513 YBR178WYBR178W 375 nt-0.02□□□□□ -2.41
TMA17Q12513 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.04□□□□□ -2.42
TMA17Q12513 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.04□□□□□ -2.42
TMA17Q12513 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.07□□□□□ -2.42
TMA17Q12513 snR45snR45 172 nt-0.1□□□□□ -2.43
TMA17Q12513 YNL170WYNL170W 396 nt-0.12□□□□□ -2.43
TMA17Q12513 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.13□□□□□ -2.43
TMA17Q12513 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.15□□□□□ -2.43
TMA17Q12513 snR50snR50 90 nt-0.16□□□□□ -2.44
TMA17Q12513 ATP8Q0080 147 nt-0.17□□□□□ -2.44
TMA17Q12513 MYO1YHR023W 5787 nt-0.18□□□□□ -2.44
TMA17Q12513 snR67snR67 82 nt-0.25□□□□□ -2.45
TMA17Q12513 SBH2YER019C-A 267 nt-0.25□□□□□ -2.45
TMA17Q12513 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.3□□□□□ -2.46
TMA17Q12513 Q0092Q0092 141 nt-0.33□□□□□ -2.46
TMA17Q12513 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.38□□□□□ -2.47
TMA17Q12513 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.39□□□□□ -2.47
TMA17Q12513 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.43□□□□□ -2.48
TMA17Q12513 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.44□□□□□ -2.48
TMA17Q12513 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.45□□□□□ -2.48
TMA17Q12513 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.46□□□□□ -2.48
TMA17Q12513 snR61snR61 90 nt-0.49□□□□□ -2.49
TMA17Q12513 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.49□□□□□ -2.49
TMA17Q12513 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.51□□□□□ -2.49
TMA17Q12513 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.53□□□□□ -2.49
TMA17Q12513 snR81snR81 201 nt-0.54□□□□□ -2.5
TMA17Q12513 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.56□□□□□ -2.5
TMA17Q12513 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.56□□□□□ -2.5
TMA17Q12513 SKI7YOR076C 2244 nt-0.57□□□□□ -2.5
TMA17Q12513 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.58□□□□□ -2.5
TMA17Q12513 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
TMA17Q12513 RPL41AYDL184C 78 nt-0.69□□□□□ -2.52
TMA17Q12513 Q0143Q0143 153 nt-0.69□□□□□ -2.52
TMA17Q12513 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.69□□□□□ -2.52
TMA17Q12513 URB1YKL014C 5295 nt-0.72□□□□□ -2.53
TMA17Q12513 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.73□□□□□ -2.53
TMA17Q12513 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.74□□□□□ -2.53
TMA17Q12513 snR47snR47 99 nt-0.76□□□□□ -2.53
TMA17Q12513 snR161snR161 161 nt-0.86□□□□□ -2.55
TMA17Q12513 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
TMA17Q12513 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
TMA17Q12513 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
TMA17Q12513 YMR326CYMR326C 309 nt-0.91□□□□□ -2.56
TMA17Q12513 snR62snR62 100 nt-0.94□□□□□ -2.56
TMA17Q12513 snR85snR85 171 nt-0.94□□□□□ -2.56
TMA17Q12513 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
TMA17Q12513 snR38snR38 95 nt-0.94□□□□□ -2.56
TMA17Q12513 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1□□□□□ -2.57
TMA17Q12513 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.02□□□□□ -2.57
TMA17Q12513 YHR217CYHR217C 462 nt-1.02□□□□□ -2.57
TMA17Q12513 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.02□□□□□ -2.57
TMA17Q12513 snR33snR33 183 nt-1.03□□□□□ -2.57
TMA17Q12513 YKL225WYKL225W 348 nt-1.07□□□□□ -2.58
TMA17Q12513 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.09□□□□□ -2.58
TMA17Q12513 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
TMA17Q12513 YBL109WYBL109W 336 nt-1.28□□□□□ -2.61
TMA17Q12513 YNR077CYNR077C 255 nt-1.34□□□□□ -2.62
TMA17Q12513 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.37□□□□□ -2.63
TMA17Q12513 snR64snR64 101 nt-1.38□□□□□ -2.63
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