Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.55□□□□□ -2.5
SKS1Q12505 YOR170WYOR170W 306 nt-0.55□□□□□ -2.5
SKS1Q12505 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.58□□□□□ -2.5
SKS1Q12505 YOR302WYOR302W 78 nt-0.58□□□□□ -2.5
SKS1Q12505 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.59□□□□□ -2.5
SKS1Q12505 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.6□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.62□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 snR39BsnR39B 96 nt-0.63□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.64□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 snR69snR69 101 nt-0.65□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.65□□□□□ -2.51
SKS1Q12505 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.69□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.69□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.69□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.71□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.72□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.72□□□□□ -2.52
SKS1Q12505 snR52snR52 92 nt-0.75□□□□□ -2.53
SKS1Q12505 snR80snR80 171 nt-0.76□□□□□ -2.53
SKS1Q12505 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.77□□□□□ -2.53
SKS1Q12505 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.77□□□□□ -2.53
SKS1Q12505 RDS3YPR094W 324 nt-0.77□□□□□ -2.53
SKS1Q12505 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.8□□□□□ -2.54
SKS1Q12505 snR161snR161 161 nt-0.8□□□□□ -2.54
SKS1Q12505 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.83□□□□□ -2.54
SKS1Q12505 snR48snR48 113 nt-0.86□□□□□ -2.55
SKS1Q12505 snR50snR50 90 nt-0.86□□□□□ -2.55
SKS1Q12505 YNL266WYNL266W 420 nt-0.87□□□□□ -2.55
SKS1Q12505 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.92□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.93□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 YNL205CYNL205C 423 nt-0.93□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.94□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 JLP2YMR132C 627 nt-0.96□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 YOR102WYOR102W 351 nt-0.97□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 YBR178WYBR178W 375 nt-0.97□□□□□ -2.56
SKS1Q12505 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.98□□□□□ -2.57
SKS1Q12505 Q0142Q0142 177 nt-0.98□□□□□ -2.57
SKS1Q12505 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1□□□□□ -2.57
SKS1Q12505 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SKS1Q12505 snR67snR67 82 nt-1.05□□□□□ -2.58
SKS1Q12505 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.06□□□□□ -2.58
SKS1Q12505 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.18□□□□□ -2.6
SKS1Q12505 YNL198CYNL198C 303 nt-1.2□□□□□ -2.6
SKS1Q12505 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.23□□□□□ -2.61
SKS1Q12505 YJL150WYJL150W 303 nt-1.24□□□□□ -2.61
SKS1Q12505 YNR077CYNR077C 255 nt-1.24□□□□□ -2.61
SKS1Q12505 SKI7YOR076C 2244 nt-1.24□□□□□ -2.61
SKS1Q12505 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.28□□□□□ -2.61
SKS1Q12505 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.29□□□□□ -2.62
SKS1Q12505 YBL053WYBL053W 375 nt-1.32□□□□□ -2.62
SKS1Q12505 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.37□□□□□ -2.63
SKS1Q12505 SPG3YDR504C 384 nt-1.39□□□□□ -2.63
SKS1Q12505 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.43□□□□□ -2.64
SKS1Q12505 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.46□□□□□ -2.64
SKS1Q12505 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.48□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.49□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 snR77snR77 88 nt-1.51□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 snR81snR81 201 nt-1.51□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.52□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.53□□□□□ -2.65
SKS1Q12505 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.54□□□□□ -2.66
SKS1Q12505 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.69□□□□□ -2.68
SKS1Q12505 YGR151CYGR151C 336 nt-1.7□□□□□ -2.68
SKS1Q12505 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.71□□□□□ -2.68
SKS1Q12505 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.76□□□□□ -2.69
SKS1Q12505 YOR309CYOR309C 381 nt-1.8□□□□□ -2.7
SKS1Q12505 YNL338WYNL338W 159 nt-1.83□□□□□ -2.7
SKS1Q12505 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.83□□□□□ -2.7
SKS1Q12505 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.84□□□□□ -2.7
SKS1Q12505 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.88□□□□□ -2.71
SKS1Q12505 RPL41AYDL184C 78 nt-1.89□□□□□ -2.71
SKS1Q12505 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.89□□□□□ -2.71
SKS1Q12505 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.93□□□□□ -2.72
SKS1Q12505 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.94□□□□□ -2.72
SKS1Q12505 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.97□□□□□ -2.72
SKS1Q12505 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.02□□□□□ -2.73
SKS1Q12505 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.03□□□□□ -2.73
SKS1Q12505 YNL337WYNL337W 255 nt-2.09□□□□□ -2.74
SKS1Q12505 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.1□□□□□ -2.75
SKS1Q12505 snR38snR38 95 nt-2.11□□□□□ -2.75
SKS1Q12505 snR47snR47 99 nt-2.11□□□□□ -2.75
SKS1Q12505 YDR543CYDR543C 300 nt-2.15□□□□□ -2.75
SKS1Q12505 Q0032Q0032 291 nt-2.21□□□□□ -2.76
SKS1Q12505 snR6snR6 112 nt-2.24□□□□□ -2.77
SKS1Q12505 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.34□□□□□ -2.78
SKS1Q12505 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.34□□□□□ -2.78
SKS1Q12505 snR73snR73 106 nt-2.35□□□□□ -2.79
SKS1Q12505 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.4□□□□□ -2.79
SKS1Q12505 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.43□□□□□ -2.8
SKS1Q12505 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.47□□□□□ -2.8
SKS1Q12505 YKL225WYKL225W 348 nt-2.47□□□□□ -2.8
SKS1Q12505 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.53□□□□□ -2.81
SKS1Q12505 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.55□□□□□ -2.82
SKS1Q12505 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.56□□□□□ -2.82
SKS1Q12505 snR61snR61 90 nt-2.57□□□□□ -2.82
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