Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 EST1YLR233C 2100 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM3Q12241 JLP2YMR132C 627 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM3Q12241 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM3Q12241 snR48snR48 113 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM3Q12241 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
VAM3Q12241 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.02□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 snR39BsnR39B 96 nt0.02□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 THO2YNL139C 4794 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.01□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 YJL150WYJL150W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 snR128snR128 126 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM3Q12241 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.05□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.05□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 YOR102WYOR102W 351 nt-0.07□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.09□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 snR45snR45 172 nt-0.09□□□□□ -2.42
VAM3Q12241 snR69snR69 101 nt-0.13□□□□□ -2.43
VAM3Q12241 YGR164WYGR164W 336 nt-0.13□□□□□ -2.43
VAM3Q12241 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.13□□□□□ -2.43
VAM3Q12241 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.15□□□□□ -2.43
VAM3Q12241 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.17□□□□□ -2.44
VAM3Q12241 YNL198CYNL198C 303 nt-0.17□□□□□ -2.44
VAM3Q12241 YNL205CYNL205C 423 nt-0.18□□□□□ -2.44
VAM3Q12241 RDS3YPR094W 324 nt-0.21□□□□□ -2.44
VAM3Q12241 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.26□□□□□ -2.45
VAM3Q12241 SEC10YLR166C 2616 nt-0.27□□□□□ -2.45
VAM3Q12241 YBL053WYBL053W 375 nt-0.27□□□□□ -2.45
VAM3Q12241 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.28□□□□□ -2.45
VAM3Q12241 SBH2YER019C-A 267 nt-0.28□□□□□ -2.45
VAM3Q12241 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.29□□□□□ -2.46
VAM3Q12241 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.3□□□□□ -2.46
VAM3Q12241 YGR151CYGR151C 336 nt-0.3□□□□□ -2.46
VAM3Q12241 YNL337WYNL337W 255 nt-0.34□□□□□ -2.46
VAM3Q12241 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.35□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 YBR178WYBR178W 375 nt-0.36□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.37□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 snR50snR50 90 nt-0.37□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.38□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 YNL266WYNL266W 420 nt-0.39□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.4□□□□□ -2.47
VAM3Q12241 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.41□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 YNL338WYNL338W 159 nt-0.41□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.43□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.45□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.46□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 Q0032Q0032 291 nt-0.47□□□□□ -2.48
VAM3Q12241 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.49□□□□□ -2.49
VAM3Q12241 snR67snR67 82 nt-0.51□□□□□ -2.49
VAM3Q12241 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.53□□□□□ -2.49
VAM3Q12241 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.54□□□□□ -2.5
VAM3Q12241 URB1YKL014C 5295 nt-0.62□□□□□ -2.51
VAM3Q12241 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.63□□□□□ -2.51
VAM3Q12241 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.69□□□□□ -2.52
VAM3Q12241 SKI7YOR076C 2244 nt-0.7□□□□□ -2.52
VAM3Q12241 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.72□□□□□ -2.52
VAM3Q12241 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.75□□□□□ -2.53
VAM3Q12241 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.78□□□□□ -2.53
VAM3Q12241 YOR225WYOR225W 330 nt-0.78□□□□□ -2.53
VAM3Q12241 snR33snR33 183 nt-0.81□□□□□ -2.54
VAM3Q12241 YLR294CYLR294C 330 nt-0.82□□□□□ -2.54
VAM3Q12241 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
VAM3Q12241 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
VAM3Q12241 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
VAM3Q12241 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.88□□□□□ -2.55
VAM3Q12241 snR161snR161 161 nt-0.88□□□□□ -2.55
VAM3Q12241 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.93□□□□□ -2.56
VAM3Q12241 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.93□□□□□ -2.56
VAM3Q12241 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.99□□□□□ -2.57
VAM3Q12241 snR81snR81 201 nt-1.03□□□□□ -2.57
VAM3Q12241 RPL41AYDL184C 78 nt-1.03□□□□□ -2.57
VAM3Q12241 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.04□□□□□ -2.58
VAM3Q12241 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.04□□□□□ -2.58
VAM3Q12241 YNL170WYNL170W 396 nt-1.06□□□□□ -2.58
VAM3Q12241 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
VAM3Q12241 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.12□□□□□ -2.59
VAM3Q12241 snR47snR47 99 nt-1.13□□□□□ -2.59
VAM3Q12241 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.15□□□□□ -2.59
VAM3Q12241 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.15□□□□□ -2.59
VAM3Q12241 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.16□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 snR61snR61 90 nt-1.17□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 ATP8Q0080 147 nt-1.19□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.19□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 snR38snR38 95 nt-1.19□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.2□□□□□ -2.6
VAM3Q12241 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
VAM3Q12241 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.25□□□□□ -2.61
VAM3Q12241 snR77snR77 88 nt-1.34□□□□□ -2.62
VAM3Q12241 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.34□□□□□ -2.62
VAM3Q12241 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.36□□□□□ -2.63
VAM3Q12241 YKL225WYKL225W 348 nt-1.41□□□□□ -2.64
VAM3Q12241 Q0092Q0092 141 nt-1.45□□□□□ -2.64
VAM3Q12241 snR62snR62 100 nt-1.46□□□□□ -2.64
VAM3Q12241 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.46□□□□□ -2.64
VAM3Q12241 YNR077CYNR077C 255 nt-1.51□□□□□ -2.65
VAM3Q12241 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.53□□□□□ -2.65
VAM3Q12241 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.54□□□□□ -2.66
VAM3Q12241 Q0143Q0143 153 nt-1.55□□□□□ -2.66
VAM3Q12241 YMR326CYMR326C 309 nt-1.68□□□□□ -2.68
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