Protein–RNA interactions for Protein: Q12235

YCT1, High affinity cysteine transporter, yeastyeast

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCT1Q12235 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.63□□□□□ -2.51
YCT1Q12235 snR69snR69 101 nt-0.64□□□□□ -2.51
YCT1Q12235 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.65□□□□□ -2.51
YCT1Q12235 YOR170WYOR170W 306 nt-0.65□□□□□ -2.51
YCT1Q12235 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.67□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 snR56snR56 88 nt-0.68□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 snR65snR65 100 nt-0.68□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.69□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.69□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 YOR302WYOR302W 78 nt-0.71□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 snR39BsnR39B 96 nt-0.71□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.72□□□□□ -2.52
YCT1Q12235 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.73□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.74□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 snR161snR161 161 nt-0.74□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.75□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 snR50snR50 90 nt-0.75□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 YNL266WYNL266W 420 nt-0.76□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 RDS3YPR094W 324 nt-0.76□□□□□ -2.53
YCT1Q12235 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.79□□□□□ -2.54
YCT1Q12235 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.83□□□□□ -2.54
YCT1Q12235 JLP2YMR132C 627 nt-0.83□□□□□ -2.54
YCT1Q12235 snR33snR33 183 nt-0.84□□□□□ -2.54
YCT1Q12235 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.86□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.87□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 snR52snR52 92 nt-0.87□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.88□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.89□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 snR80snR80 171 nt-0.9□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 YBR178WYBR178W 375 nt-0.9□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 snR48snR48 113 nt-0.9□□□□□ -2.55
YCT1Q12235 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.91□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.92□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.92□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 YNR077CYNR077C 255 nt-0.92□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 YNL205CYNL205C 423 nt-0.93□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 snR67snR67 82 nt-0.94□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.94□□□□□ -2.56
YCT1Q12235 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.98□□□□□ -2.57
YCT1Q12235 SKI7YOR076C 2244 nt-1□□□□□ -2.57
YCT1Q12235 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.01□□□□□ -2.57
YCT1Q12235 YOR102WYOR102W 351 nt-1.01□□□□□ -2.57
YCT1Q12235 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.12□□□□□ -2.59
YCT1Q12235 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.13□□□□□ -2.59
YCT1Q12235 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.14□□□□□ -2.59
YCT1Q12235 YNL198CYNL198C 303 nt-1.16□□□□□ -2.6
YCT1Q12235 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.17□□□□□ -2.6
YCT1Q12235 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.21□□□□□ -2.6
YCT1Q12235 YBL053WYBL053W 375 nt-1.22□□□□□ -2.6
YCT1Q12235 YJL150WYJL150W 303 nt-1.24□□□□□ -2.61
YCT1Q12235 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.32□□□□□ -2.62
YCT1Q12235 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.36□□□□□ -2.63
YCT1Q12235 Q0142Q0142 177 nt-1.4□□□□□ -2.63
YCT1Q12235 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.4□□□□□ -2.63
YCT1Q12235 snR77snR77 88 nt-1.41□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.42□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.42□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.43□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.43□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 SPG3YDR504C 384 nt-1.46□□□□□ -2.64
YCT1Q12235 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.56□□□□□ -2.66
YCT1Q12235 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.58□□□□□ -2.66
YCT1Q12235 YGR151CYGR151C 336 nt-1.6□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.6□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 snR81snR81 201 nt-1.61□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.62□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.62□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.62□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.63□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 RPL41AYDL184C 78 nt-1.64□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.64□□□□□ -2.67
YCT1Q12235 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.66□□□□□ -2.68
YCT1Q12235 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.68□□□□□ -2.68
YCT1Q12235 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.68□□□□□ -2.68
YCT1Q12235 snR38snR38 95 nt-1.72□□□□□ -2.68
YCT1Q12235 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.74□□□□□ -2.69
YCT1Q12235 YNL338WYNL338W 159 nt-1.76□□□□□ -2.69
YCT1Q12235 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.8□□□□□ -2.7
YCT1Q12235 snR47snR47 99 nt-1.81□□□□□ -2.7
YCT1Q12235 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
YCT1Q12235 YOR309CYOR309C 381 nt-1.89□□□□□ -2.71
YCT1Q12235 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.9□□□□□ -2.71
YCT1Q12235 YNL337WYNL337W 255 nt-1.94□□□□□ -2.72
YCT1Q12235 YDR543CYDR543C 300 nt-2.02□□□□□ -2.73
YCT1Q12235 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.03□□□□□ -2.73
YCT1Q12235 YKL225WYKL225W 348 nt-2.08□□□□□ -2.74
YCT1Q12235 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.08□□□□□ -2.74
YCT1Q12235 snR6snR6 112 nt-2.09□□□□□ -2.74
YCT1Q12235 Q0032Q0032 291 nt-2.17□□□□□ -2.76
YCT1Q12235 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.17□□□□□ -2.76
YCT1Q12235 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.18□□□□□ -2.76
YCT1Q12235 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.21□□□□□ -2.76
YCT1Q12235 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.23□□□□□ -2.77
YCT1Q12235 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.24□□□□□ -2.77
YCT1Q12235 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.25□□□□□ -2.77
YCT1Q12235 snR73snR73 106 nt-2.26□□□□□ -2.77
YCT1Q12235 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.26□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.1 ms