Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 YER181CYER181C 324 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 YJL182CYJL182C 318 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 GIM4YEL003W 336 nt-0.76□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 YFL019CYFL019C 354 nt-0.76□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 snR33snR33 183 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 snR49snR49 165 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRA1Q12159 snR55snR55 98 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 YOR170WYOR170W 306 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 snR39BsnR39B 96 nt-0.8□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 RDS3YPR094W 324 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.82□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 snR50snR50 90 nt-0.82□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 YNL266WYNL266W 420 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRA1Q12159 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRA1Q12159 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.92□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 JLP2YMR132C 627 nt-0.93□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 snR65snR65 100 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 snR67snR67 82 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 YOR302WYOR302W 78 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRA1Q12159 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 YBR178WYBR178W 375 nt-1□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 YNL205CYNL205C 423 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.03□□□□□ -2.57
YRA1Q12159 snR48snR48 113 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 SKI7YOR076C 2244 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 snR52snR52 92 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 YOR102WYOR102W 351 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.09□□□□□ -2.58
YRA1Q12159 snR56snR56 88 nt-1.1□□□□□ -2.59
YRA1Q12159 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.11□□□□□ -2.59
YRA1Q12159 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRA1Q12159 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.17□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 snR80snR80 171 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRA1Q12159 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRA1Q12159 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRA1Q12159 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.35□□□□□ -2.63
YRA1Q12159 YNL198CYNL198C 303 nt-1.35□□□□□ -2.63
YRA1Q12159 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRA1Q12159 snR77snR77 88 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRA1Q12159 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRA1Q12159 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.43□□□□□ -2.64
YRA1Q12159 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.44□□□□□ -2.64
YRA1Q12159 Q0142Q0142 177 nt-1.45□□□□□ -2.64
YRA1Q12159 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.47□□□□□ -2.64
YRA1Q12159 YBL053WYBL053W 375 nt-1.47□□□□□ -2.64
YRA1Q12159 YJL150WYJL150W 303 nt-1.48□□□□□ -2.65
YRA1Q12159 snR81snR81 201 nt-1.5□□□□□ -2.65
YRA1Q12159 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.51□□□□□ -2.65
YRA1Q12159 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.52□□□□□ -2.65
YRA1Q12159 YDR543CYDR543C 300 nt-1.55□□□□□ -2.66
YRA1Q12159 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.57□□□□□ -2.66
YRA1Q12159 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.58□□□□□ -2.66
YRA1Q12159 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.63□□□□□ -2.67
YRA1Q12159 RPL41AYDL184C 78 nt-1.66□□□□□ -2.68
YRA1Q12159 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.67□□□□□ -2.68
YRA1Q12159 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.68□□□□□ -2.68
YRA1Q12159 YGR151CYGR151C 336 nt-1.69□□□□□ -2.68
YRA1Q12159 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.73□□□□□ -2.69
YRA1Q12159 SPG3YDR504C 384 nt-1.74□□□□□ -2.69
YRA1Q12159 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRA1Q12159 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.77□□□□□ -2.69
YRA1Q12159 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.8□□□□□ -2.7
YRA1Q12159 snR38snR38 95 nt-1.8□□□□□ -2.7
YRA1Q12159 YOR309CYOR309C 381 nt-1.82□□□□□ -2.7
YRA1Q12159 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.85□□□□□ -2.71
YRA1Q12159 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.87□□□□□ -2.71
YRA1Q12159 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.88□□□□□ -2.71
YRA1Q12159 snR47snR47 99 nt-1.88□□□□□ -2.71
YRA1Q12159 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.91□□□□□ -2.72
YRA1Q12159 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.92□□□□□ -2.72
YRA1Q12159 YNL338WYNL338W 159 nt-1.99□□□□□ -2.73
YRA1Q12159 snR6snR6 112 nt-2.04□□□□□ -2.74
YRA1Q12159 YNL337WYNL337W 255 nt-2.07□□□□□ -2.74
YRA1Q12159 YKL225WYKL225W 348 nt-2.11□□□□□ -2.75
YRA1Q12159 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.12□□□□□ -2.75
YRA1Q12159 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.14□□□□□ -2.75
YRA1Q12159 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.14□□□□□ -2.75
YRA1Q12159 snR73snR73 106 nt-2.2□□□□□ -2.76
YRA1Q12159 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.2□□□□□ -2.76
YRA1Q12159 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.23□□□□□ -2.77
YRA1Q12159 snR85snR85 171 nt-2.29□□□□□ -2.78
YRA1Q12159 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.29□□□□□ -2.78
YRA1Q12159 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.34□□□□□ -2.78
YRA1Q12159 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.36□□□□□ -2.79
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