Protein–RNA interactions for Protein: Q12125

GET4, Golgi to ER traffic protein 4, yeast

Predictions only

Length 312 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GET4	Q12125	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
GET4	Q12125	VAR1	Q0140	1197 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	RDS3	YPR094W	324 nt		-1	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	YKL118W	YKL118W	312 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	snR39B	snR39B	96 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
GET4	Q12125	YER181C	YER181C	324 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
GET4	Q12125	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
GET4	Q12125	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
GET4	Q12125	snR55	snR55	98 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	YPR012W	YPR012W	255 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	snR161	snR161	161 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	GIM4	YEL003W	336 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	snR67	snR67	82 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
GET4	Q12125	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
GET4	Q12125	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
GET4	Q12125	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
GET4	Q12125	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
GET4	Q12125	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
GET4	Q12125	Q0144	Q0144	330 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
GET4	Q12125	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
GET4	Q12125	YOR302W	YOR302W	78 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
GET4	Q12125	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
GET4	Q12125	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	snR48	snR48	113 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	snR65	snR65	100 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
GET4	Q12125	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
GET4	Q12125	snR52	snR52	92 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
GET4	Q12125	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
GET4	Q12125	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	snR77	snR77	88 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
GET4	Q12125	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
GET4	Q12125	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
GET4	Q12125	snR80	snR80	171 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
GET4	Q12125	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
GET4	Q12125	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
GET4	Q12125	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
GET4	Q12125	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
GET4	Q12125	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
GET4	Q12125	snR56	snR56	88 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
GET4	Q12125	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
GET4	Q12125	snR81	snR81	201 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
GET4	Q12125	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
GET4	Q12125	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
GET4	Q12125	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
GET4	Q12125	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
GET4	Q12125	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
GET4	Q12125	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
GET4	Q12125	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
GET4	Q12125	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
GET4	Q12125	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
GET4	Q12125	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
GET4	Q12125	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
GET4	Q12125	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
GET4	Q12125	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
GET4	Q12125	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
GET4	Q12125	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2	□□□□□ -2.73
GET4	Q12125	snR38	snR38	95 nt		-2	□□□□□ -2.73
GET4	Q12125	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
GET4	Q12125	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
GET4	Q12125	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
GET4	Q12125	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
GET4	Q12125	SPG3	YDR504C	384 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
GET4	Q12125	snR47	snR47	99 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
GET4	Q12125	snR6	snR6	112 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
GET4	Q12125	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
GET4	Q12125	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
GET4	Q12125	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
GET4	Q12125	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-2.28	□□□□□ -2.77
GET4	Q12125	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.31	□□□□□ -2.78
GET4	Q12125	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-2.33	□□□□□ -2.78
GET4	Q12125	snR73	snR73	106 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
GET4	Q12125	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
GET4	Q12125	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
GET4	Q12125	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.4	□□□□□ -2.79
GET4	Q12125	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
GET4	Q12125	YNL338W	YNL338W	159 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
GET4	Q12125	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
GET4	Q12125	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
GET4	Q12125	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
GET4	Q12125	Q0142	Q0142	177 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
GET4	Q12125	snR85	snR85	171 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
GET4	Q12125	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.67	□□□□□ -2.84
GET4	Q12125	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
GET4	Q12125	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-2.73	□□□□□ -2.85
GET4	Q12125	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
GET4	Q12125	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-2.77	□□□□□ -2.85

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