Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 YOR102WYOR102W 351 nt0.33□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 CSE1YGL238W 2883 nt0.33□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 YGR151CYGR151C 336 nt0.32□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.32□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 BIR1YJR089W 2865 nt0.29□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.29□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 snR39BsnR39B 96 nt0.29□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.28□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.28□□□□□ -2.36
SMF3Q12078 YBL053WYBL053W 375 nt0.27□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.27□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 ESP1YGR098C 4893 nt0.27□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 Q0032Q0032 291 nt0.25□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.25□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YNL338WYNL338W 159 nt0.25□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YBR099CYBR099C 384 nt0.24□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.24□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.23□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.23□□□□□ -2.37
SMF3Q12078 THO2YNL139C 4794 nt0.2□□□□□ -2.38
SMF3Q12078 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.18□□□□□ -2.38
SMF3Q12078 EST1YLR233C 2100 nt0.16□□□□□ -2.38
SMF3Q12078 YOR225WYOR225W 330 nt0.15□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 SOV1YMR066W 2697 nt0.15□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.12□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 YNL205CYNL205C 423 nt0.12□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 PMP2YEL017C-A 132 nt0.11□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 snR69snR69 101 nt0.1□□□□□ -2.39
SMF3Q12078 YLR294CYLR294C 330 nt0.06□□□□□ -2.4
SMF3Q12078 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.05□□□□□ -2.4
SMF3Q12078 SOM1YEL059C-A 225 nt0.04□□□□□ -2.4
SMF3Q12078 YGR164WYGR164W 336 nt0.04□□□□□ -2.4
SMF3Q12078 SEC10YLR166C 2616 nt0.04□□□□□ -2.4
SMF3Q12078 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.02□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.02□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 snR128snR128 126 nt0.02□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 RDS3YPR094W 324 nt0.02□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 YNL266WYNL266W 420 nt-0.01□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 snR45snR45 172 nt-0.01□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 YBR178WYBR178W 375 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMF3Q12078 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.04□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.05□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.05□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.08□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.09□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.09□□□□□ -2.42
SMF3Q12078 snR50snR50 90 nt-0.1□□□□□ -2.43
SMF3Q12078 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.11□□□□□ -2.43
SMF3Q12078 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMF3Q12078 YNL170WYNL170W 396 nt-0.2□□□□□ -2.44
SMF3Q12078 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
SMF3Q12078 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.25□□□□□ -2.45
SMF3Q12078 snR67snR67 82 nt-0.25□□□□□ -2.45
SMF3Q12078 ATP8Q0080 147 nt-0.25□□□□□ -2.45
SMF3Q12078 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.26□□□□□ -2.45
SMF3Q12078 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.27□□□□□ -2.45
SMF3Q12078 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.31□□□□□ -2.46
SMF3Q12078 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.34□□□□□ -2.46
SMF3Q12078 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.35□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.36□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 SKI7YOR076C 2244 nt-0.37□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 Q0092Q0092 141 nt-0.38□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.38□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.38□□□□□ -2.47
SMF3Q12078 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.41□□□□□ -2.48
SMF3Q12078 snR81snR81 201 nt-0.42□□□□□ -2.48
SMF3Q12078 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.44□□□□□ -2.48
SMF3Q12078 snR61snR61 90 nt-0.46□□□□□ -2.48
SMF3Q12078 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.5□□□□□ -2.49
SMF3Q12078 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.53□□□□□ -2.49
SMF3Q12078 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 RPL41AYDL184C 78 nt-0.54□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.54□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 snR47snR47 99 nt-0.55□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.56□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.56□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 Q0143Q0143 153 nt-0.58□□□□□ -2.5
SMF3Q12078 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.6□□□□□ -2.51
SMF3Q12078 snR161snR161 161 nt-0.6□□□□□ -2.51
SMF3Q12078 snR38snR38 95 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMF3Q12078 snR33snR33 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
SMF3Q12078 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.69□□□□□ -2.52
SMF3Q12078 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.7□□□□□ -2.52
SMF3Q12078 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.71□□□□□ -2.52
SMF3Q12078 snR62snR62 100 nt-0.74□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.76□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 YMR326CYMR326C 309 nt-0.77□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 YKL225WYKL225W 348 nt-0.78□□□□□ -2.53
SMF3Q12078 snR85snR85 171 nt-0.8□□□□□ -2.54
SMF3Q12078 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.81□□□□□ -2.54
SMF3Q12078 YHR217CYHR217C 462 nt-0.84□□□□□ -2.54
SMF3Q12078 snR77snR77 88 nt-0.93□□□□□ -2.56
SMF3Q12078 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.94□□□□□ -2.56
SMF3Q12078 YBL109WYBL109W 336 nt-0.95□□□□□ -2.56
SMF3Q12078 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.97□□□□□ -2.56
SMF3Q12078 snR64snR64 101 nt-1.01□□□□□ -2.57
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