Protein–RNA interactions for Protein: Q12063

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUS1Q12063 YOR102WYOR102W 351 nt0.44□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 Q0032Q0032 291 nt0.43□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.43□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 YBL053WYBL053W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 ESP1YGR098C 4893 nt0.43□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.42□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.41□□□□□ -2.34
NUS1Q12063 QCR9YGR183C 201 nt0.39□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 CSE1YGL238W 2883 nt0.39□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 BIR1YJR089W 2865 nt0.39□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 YNL338WYNL338W 159 nt0.38□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.35□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 YOR225WYOR225W 330 nt0.35□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 MLP2YIL149C 5040 nt0.35□□□□□ -2.35
NUS1Q12063 YBR099CYBR099C 384 nt0.34□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 AI1Q0050 2505 nt0.32□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.31□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 YOL014WYOL014W 375 nt0.3□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.3□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
NUS1Q12063 SOV1YMR066W 2697 nt0.26□□□□□ -2.37
NUS1Q12063 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
NUS1Q12063 EST1YLR233C 2100 nt0.22□□□□□ -2.37
NUS1Q12063 YLR294CYLR294C 330 nt0.19□□□□□ -2.38
NUS1Q12063 YNL205CYNL205C 423 nt0.19□□□□□ -2.38
NUS1Q12063 snR69snR69 101 nt0.18□□□□□ -2.38
NUS1Q12063 PMP2YEL017C-A 132 nt0.18□□□□□ -2.38
NUS1Q12063 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.17□□□□□ -2.38
NUS1Q12063 THO2YNL139C 4794 nt0.1□□□□□ -2.39
NUS1Q12063 SOM1YEL059C-A 225 nt0.09□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.09□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 SEC10YLR166C 2616 nt0.09□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YGR164WYGR164W 336 nt0.08□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 RDS3YPR094W 324 nt0.07□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.06□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.06□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.04□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YNL266WYNL266W 420 nt0.04□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.03□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.03□□□□□ -2.4
NUS1Q12063 snR128snR128 126 nt0.01□□□□□ -2.41
NUS1Q12063 YBR178WYBR178W 375 nt-0.01□□□□□ -2.41
NUS1Q12063 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.05□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.07□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.07□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 snR45snR45 172 nt-0.07□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.09□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 snR50snR50 90 nt-0.09□□□□□ -2.42
NUS1Q12063 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.11□□□□□ -2.43
NUS1Q12063 YNL170WYNL170W 396 nt-0.17□□□□□ -2.44
NUS1Q12063 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.18□□□□□ -2.44
NUS1Q12063 ATP8Q0080 147 nt-0.21□□□□□ -2.44
NUS1Q12063 SBH2YER019C-A 267 nt-0.22□□□□□ -2.44
NUS1Q12063 snR67snR67 82 nt-0.28□□□□□ -2.45
NUS1Q12063 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.3□□□□□ -2.46
NUS1Q12063 Q0092Q0092 141 nt-0.35□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.35□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.36□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.37□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.38□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.39□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.4□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.4□□□□□ -2.47
NUS1Q12063 SKI7YOR076C 2244 nt-0.42□□□□□ -2.48
NUS1Q12063 snR81snR81 201 nt-0.43□□□□□ -2.48
NUS1Q12063 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.47□□□□□ -2.48
NUS1Q12063 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.47□□□□□ -2.48
NUS1Q12063 snR61snR61 90 nt-0.51□□□□□ -2.49
NUS1Q12063 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.52□□□□□ -2.49
NUS1Q12063 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.55□□□□□ -2.5
NUS1Q12063 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
NUS1Q12063 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.61□□□□□ -2.51
NUS1Q12063 Q0143Q0143 153 nt-0.65□□□□□ -2.51
NUS1Q12063 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.65□□□□□ -2.51
NUS1Q12063 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.66□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 snR47snR47 99 nt-0.67□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.67□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.67□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 RPL41AYDL184C 78 nt-0.68□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 snR161snR161 161 nt-0.7□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 snR33snR33 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 snR38snR38 95 nt-0.72□□□□□ -2.52
NUS1Q12063 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.83□□□□□ -2.54
NUS1Q12063 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.84□□□□□ -2.54
NUS1Q12063 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
NUS1Q12063 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
NUS1Q12063 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
NUS1Q12063 snR62snR62 100 nt-0.87□□□□□ -2.55
NUS1Q12063 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.87□□□□□ -2.55
NUS1Q12063 snR85snR85 171 nt-0.88□□□□□ -2.55
NUS1Q12063 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.92□□□□□ -2.56
NUS1Q12063 YMR326CYMR326C 309 nt-0.93□□□□□ -2.56
NUS1Q12063 YKL225WYKL225W 348 nt-0.94□□□□□ -2.56
NUS1Q12063 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.96□□□□□ -2.56
NUS1Q12063 YHR217CYHR217C 462 nt-0.96□□□□□ -2.56
NUS1Q12063 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.99□□□□□ -2.57
NUS1Q12063 snR77snR77 88 nt-1.04□□□□□ -2.58
NUS1Q12063 YBL109WYBL109W 336 nt-1.05□□□□□ -2.58
NUS1Q12063 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.08□□□□□ -2.58
NUS1Q12063 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.18□□□□□ -2.6
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