Protein–RNA interactions for Protein: Q12025

YDR056C, Uncharacterized protein YDR056C, yeastyeast

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR056CQ12025 YDR210WYDR210W 228 nt-0.01□□□□□ -2.41
YDR056CQ12025 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.01□□□□□ -2.41
YDR056CQ12025 snR128snR128 126 nt-0.04□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.05□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 snR45snR45 172 nt-0.05□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 snR39BsnR39B 96 nt-0.06□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.07□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 snR48snR48 113 nt-0.08□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 SPG3YDR504C 384 nt-0.09□□□□□ -2.42
YDR056CQ12025 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.12□□□□□ -2.43
YDR056CQ12025 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.12□□□□□ -2.43
YDR056CQ12025 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.14□□□□□ -2.43
YDR056CQ12025 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.16□□□□□ -2.44
YDR056CQ12025 JLP2YMR132C 627 nt-0.21□□□□□ -2.44
YDR056CQ12025 YOR102WYOR102W 351 nt-0.22□□□□□ -2.44
YDR056CQ12025 YGR164WYGR164W 336 nt-0.23□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.24□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 snR69snR69 101 nt-0.24□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.27□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.27□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.28□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 YNL205CYNL205C 423 nt-0.28□□□□□ -2.45
YDR056CQ12025 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.29□□□□□ -2.46
YDR056CQ12025 YJL150WYJL150W 303 nt-0.3□□□□□ -2.46
YDR056CQ12025 SBH2YER019C-A 267 nt-0.31□□□□□ -2.46
YDR056CQ12025 RDS3YPR094W 324 nt-0.31□□□□□ -2.46
YDR056CQ12025 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
YDR056CQ12025 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.39□□□□□ -2.47
YDR056CQ12025 SEC10YLR166C 2616 nt-0.41□□□□□ -2.48
YDR056CQ12025 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.42□□□□□ -2.48
YDR056CQ12025 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.43□□□□□ -2.48
YDR056CQ12025 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.43□□□□□ -2.48
YDR056CQ12025 YNL198CYNL198C 303 nt-0.44□□□□□ -2.48
YDR056CQ12025 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.5□□□□□ -2.49
YDR056CQ12025 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.54□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 YBR178WYBR178W 375 nt-0.55□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.56□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 YNL266WYNL266W 420 nt-0.56□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 YGR151CYGR151C 336 nt-0.57□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 snR50snR50 90 nt-0.57□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.58□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.58□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 URB1YKL014C 5295 nt-0.59□□□□□ -2.5
YDR056CQ12025 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.6□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.6□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.61□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.61□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YNL337WYNL337W 255 nt-0.62□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YBL053WYBL053W 375 nt-0.63□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 snR67snR67 82 nt-0.65□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.66□□□□□ -2.51
YDR056CQ12025 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.71□□□□□ -2.52
YDR056CQ12025 Q0032Q0032 291 nt-0.74□□□□□ -2.53
YDR056CQ12025 YNL338WYNL338W 159 nt-0.77□□□□□ -2.53
YDR056CQ12025 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
YDR056CQ12025 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
YDR056CQ12025 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
YDR056CQ12025 snR33snR33 183 nt-0.87□□□□□ -2.55
YDR056CQ12025 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.92□□□□□ -2.56
YDR056CQ12025 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.96□□□□□ -2.56
YDR056CQ12025 SKI7YOR076C 2244 nt-0.96□□□□□ -2.56
YDR056CQ12025 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1□□□□□ -2.57
YDR056CQ12025 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.02□□□□□ -2.57
YDR056CQ12025 snR161snR161 161 nt-1.08□□□□□ -2.58
YDR056CQ12025 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.21□□□□□ -2.6
YDR056CQ12025 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.22□□□□□ -2.6
YDR056CQ12025 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
YDR056CQ12025 YLR294CYLR294C 330 nt-1.27□□□□□ -2.61
YDR056CQ12025 YOR225WYOR225W 330 nt-1.27□□□□□ -2.61
YDR056CQ12025 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.29□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 RPL41AYDL184C 78 nt-1.31□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.31□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.32□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.33□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.34□□□□□ -2.62
YDR056CQ12025 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.39□□□□□ -2.63
YDR056CQ12025 snR81snR81 201 nt-1.41□□□□□ -2.64
YDR056CQ12025 YNR077CYNR077C 255 nt-1.42□□□□□ -2.64
YDR056CQ12025 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.43□□□□□ -2.64
YDR056CQ12025 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.45□□□□□ -2.64
YDR056CQ12025 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.49□□□□□ -2.65
YDR056CQ12025 YNL170WYNL170W 396 nt-1.51□□□□□ -2.65
YDR056CQ12025 snR47snR47 99 nt-1.51□□□□□ -2.65
YDR056CQ12025 snR77snR77 88 nt-1.52□□□□□ -2.65
YDR056CQ12025 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.53□□□□□ -2.65
YDR056CQ12025 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.54□□□□□ -2.66
YDR056CQ12025 snR61snR61 90 nt-1.56□□□□□ -2.66
YDR056CQ12025 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.6□□□□□ -2.67
YDR056CQ12025 snR38snR38 95 nt-1.6□□□□□ -2.67
YDR056CQ12025 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.64□□□□□ -2.67
YDR056CQ12025 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.66□□□□□ -2.68
YDR056CQ12025 ATP8Q0080 147 nt-1.69□□□□□ -2.68
YDR056CQ12025 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.75□□□□□ -2.69
YDR056CQ12025 YKL225WYKL225W 348 nt-1.82□□□□□ -2.7
YDR056CQ12025 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.84□□□□□ -2.7
YDR056CQ12025 snR62snR62 100 nt-1.88□□□□□ -2.71
YDR056CQ12025 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.91□□□□□ -2.72
YDR056CQ12025 Q0092Q0092 141 nt-2.02□□□□□ -2.73
YDR056CQ12025 Q0143Q0143 153 nt-2.11□□□□□ -2.75
YDR056CQ12025 YOR309CYOR309C 381 nt-2.11□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms