Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 snR46snR46 197 nt-0.01□□□□□ -2.41
VPS68Q12016 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.02□□□□□ -2.41
VPS68Q12016 MLP2YIL149C 5040 nt-0.03□□□□□ -2.41
VPS68Q12016 snR39BsnR39B 96 nt-0.04□□□□□ -2.42
VPS68Q12016 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.09□□□□□ -2.42
VPS68Q12016 YGR164WYGR164W 336 nt-0.1□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 SPG3YDR504C 384 nt-0.11□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.11□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 JLP2YMR132C 627 nt-0.11□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YJL150WYJL150W 303 nt-0.12□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.13□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.13□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.13□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 snR48snR48 113 nt-0.13□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 snR69snR69 101 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YOR102WYOR102W 351 nt-0.14□□□□□ -2.43
VPS68Q12016 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.16□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.18□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.18□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 YNL198CYNL198C 303 nt-0.18□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 SBH2YER019C-A 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 YBL053WYBL053W 375 nt-0.2□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 RDS3YPR094W 324 nt-0.21□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.22□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.22□□□□□ -2.44
VPS68Q12016 YNL205CYNL205C 423 nt-0.23□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YBR178WYBR178W 375 nt-0.24□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 snR50snR50 90 nt-0.24□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.25□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 RPM2YML091C 3609 nt-0.25□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 SEC10YLR166C 2616 nt-0.26□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.26□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.26□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.26□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.27□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.28□□□□□ -2.45
VPS68Q12016 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.3□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YNL266WYNL266W 420 nt-0.3□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YGR151CYGR151C 336 nt-0.31□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.31□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.32□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.33□□□□□ -2.46
VPS68Q12016 YNL338WYNL338W 159 nt-0.35□□□□□ -2.47
VPS68Q12016 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.36□□□□□ -2.47
VPS68Q12016 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.36□□□□□ -2.47
VPS68Q12016 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.38□□□□□ -2.47
VPS68Q12016 snR67snR67 82 nt-0.4□□□□□ -2.47
VPS68Q12016 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.42□□□□□ -2.48
VPS68Q12016 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.45□□□□□ -2.48
VPS68Q12016 YNL337WYNL337W 255 nt-0.45□□□□□ -2.48
VPS68Q12016 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.52□□□□□ -2.49
VPS68Q12016 SKI7YOR076C 2244 nt-0.53□□□□□ -2.49
VPS68Q12016 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.54□□□□□ -2.5
VPS68Q12016 Q0032Q0032 291 nt-0.58□□□□□ -2.5
VPS68Q12016 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.58□□□□□ -2.5
VPS68Q12016 snR161snR161 161 nt-0.6□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.61□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 URB1YKL014C 5295 nt-0.61□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 snR33snR33 183 nt-0.63□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.64□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
VPS68Q12016 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.72□□□□□ -2.52
VPS68Q12016 YLR294CYLR294C 330 nt-0.74□□□□□ -2.53
VPS68Q12016 RPL41AYDL184C 78 nt-0.77□□□□□ -2.53
VPS68Q12016 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.77□□□□□ -2.53
VPS68Q12016 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.77□□□□□ -2.53
VPS68Q12016 YOR225WYOR225W 330 nt-0.77□□□□□ -2.53
VPS68Q12016 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.79□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 snR81snR81 201 nt-0.8□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.81□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 snR47snR47 99 nt-0.81□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.82□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.84□□□□□ -2.54
VPS68Q12016 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.87□□□□□ -2.55
VPS68Q12016 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.88□□□□□ -2.55
VPS68Q12016 YNL170WYNL170W 396 nt-0.89□□□□□ -2.55
VPS68Q12016 snR38snR38 95 nt-0.89□□□□□ -2.55
VPS68Q12016 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.9□□□□□ -2.55
VPS68Q12016 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.92□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 snR77snR77 88 nt-0.94□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.95□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 snR61snR61 90 nt-0.96□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.96□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.97□□□□□ -2.56
VPS68Q12016 ATP8Q0080 147 nt-1.01□□□□□ -2.57
VPS68Q12016 YKL225WYKL225W 348 nt-1.04□□□□□ -2.58
VPS68Q12016 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.04□□□□□ -2.58
VPS68Q12016 YNR077CYNR077C 255 nt-1.04□□□□□ -2.58
VPS68Q12016 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.08□□□□□ -2.58
VPS68Q12016 snR62snR62 100 nt-1.15□□□□□ -2.59
VPS68Q12016 Q0092Q0092 141 nt-1.2□□□□□ -2.6
VPS68Q12016 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.22□□□□□ -2.6
VPS68Q12016 Q0143Q0143 153 nt-1.25□□□□□ -2.61
VPS68Q12016 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.26□□□□□ -2.61
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