Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSC1Q08554 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSC1Q08554 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC1Q08554 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms