Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms