Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR3Q06889 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms