Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.4	□□□□□ -2.34
MRD1	Q06106	YNL338W	YNL338W	159 nt		0.4	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	YOR102W	YOR102W	351 nt		0.4	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		0.38	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	RCO1	YMR075W	2055 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	snR39B	snR39B	96 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	snR48	snR48	113 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRD1	Q06106	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.31	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		0.31	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.31	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		0.29	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	Q0032	Q0032	291 nt		0.28	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		0.28	□□□□□ -2.36
MRD1	Q06106	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	RPM2	YML091C	3609 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	YBR099C	YBR099C	384 nt		0.26	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.25	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	THO2	YNL139C	4794 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRD1	Q06106	YOR225W	YOR225W	330 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRD1	Q06106	EST1	YLR233C	2100 nt		0.2	□□□□□ -2.38
MRD1	Q06106	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.18	□□□□□ -2.38
MRD1	Q06106	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		0.16	□□□□□ -2.38
MRD1	Q06106	snR69	snR69	101 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	YLR294C	YLR294C	330 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	PMP2	YEL017C-A	132 nt		0.14	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	YNL205C	YNL205C	423 nt		0.14	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		0.11	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		0.11	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	SOM1	YEL059C-A	225 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRD1	Q06106	YGR164W	YGR164W	336 nt		0.07	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	SEC10	YLR166C	2616 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	YBR178W	YBR178W	375 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	snR128	snR128	126 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	RDS3	YPR094W	324 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		0.04	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	YNL266W	YNL266W	420 nt		0.04	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		0.03	□□□□□ -2.4
MRD1	Q06106	snR45	snR45	172 nt		0.02	□□□□□ -2.41
MRD1	Q06106	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRD1	Q06106	snR50	snR50	90 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRD1	Q06106	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
MRD1	Q06106	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
MRD1	Q06106	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
MRD1	Q06106	YNL170W	YNL170W	396 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
MRD1	Q06106	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
MRD1	Q06106	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
MRD1	Q06106	ATP8	Q0080	147 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
MRD1	Q06106	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
MRD1	Q06106	snR67	snR67	82 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
MRD1	Q06106	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
MRD1	Q06106	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
MRD1	Q06106	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
MRD1	Q06106	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	Q0092	Q0092	141 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
MRD1	Q06106	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
MRD1	Q06106	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
MRD1	Q06106	snR81	snR81	201 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
MRD1	Q06106	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
MRD1	Q06106	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
MRD1	Q06106	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
MRD1	Q06106	snR61	snR61	90 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
MRD1	Q06106	snR47	snR47	99 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
MRD1	Q06106	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
MRD1	Q06106	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
MRD1	Q06106	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
MRD1	Q06106	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
MRD1	Q06106	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
MRD1	Q06106	Q0143	Q0143	153 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
MRD1	Q06106	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
MRD1	Q06106	snR161	snR161	161 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
MRD1	Q06106	snR38	snR38	95 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
MRD1	Q06106	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
MRD1	Q06106	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
MRD1	Q06106	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
MRD1	Q06106	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	snR85	snR85	171 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	snR33	snR33	183 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	snR62	snR62	100 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	YKL225W	YKL225W	348 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
MRD1	Q06106	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
MRD1	Q06106	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
MRD1	Q06106	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
MRD1	Q06106	YMR326C	YMR326C	309 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
MRD1	Q06106	YHR217C	YHR217C	462 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
MRD1	Q06106	YBL109W	YBL109W	336 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
MRD1	Q06106	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
MRD1	Q06106	snR77	snR77	88 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
MRD1	Q06106	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
MRD1	Q06106	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
MRD1	Q06106	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-1.01	□□□□□ -2.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.2 ms