Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms